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Species belonging to selected taxon:

Volvox carteri



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002830
species: Volvox carteri
miRNA family: MIR414
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Volvox carteri Volvox Volvocaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ACATCATCATCATCATCATCA

miRNA*
GTGGTGGTGGTGGTGGGGCAT

mismatches: 3
bulges: 0

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pre-miRNA
TGCATCGCACTACATCATCATCATCATCATCATCATCATTTCGGCATTCTTGGGACGACACACACATACACACACACACACGCGCGCGCGCGTGCCTATC
CACGACATTTACATAGATATATAGCTCTCCTACATGCATGCGTAGTGCATGCATGTACGGGGATGGGGGGGGAAACCGGAGGGGAAGAAATGTGCGGCCG
AACCAAAGGTGATGACGAGATGCGCGCGGCGGTGTGGCTGCATCTATCTACGTGAAACGGTGTTTCACGTGGTGGTGATGGTGATGAGTGTGATGGTGAC
GATGATGGTCGTAATGACAGCGATGATGATGATGCCGATGCTGATGCTGATTTTAAGGATGTCGCGGATAGGCGTGCGCGGGCGCTGCTGCTGCTACTGC
TGCTGCTGCTGCTGCTCTGTGTGTTCCAGACTGGTGGGGAGGCCTTCCGGACGTTTTAGAGCCTTTTACGCCTCCTATCAGCTGCCCGCTACCCCTCCTG
GCCCCTCCCTTCTCTCATCTACCTCGCGGTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGGTCATC
GCACCATCGGGCTCATAGCGATTTCCAGCAGGACTAACTGCTGCTCGCGAGATCTCCACAACCGGTGACATTTTGCATACGCATTTTTGTTGTTTTGGGG
TTTACTCCGGGGGATTCGTTCCCCGGGTAGTTTGAGGTGCCTGCCGTTTTTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGCATTGCGACTG


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

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UniProt no hits

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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