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Species belonging to selected taxon:

Agrostis stolonifera, Oryza sativa, Avena barbata, Avena sativa, Curcuma longa, Cynodon dactylon, Elaeis guineensis, Eragrostis curvula, Festuca arundinacea, Festuca pratensis, Hordeum vulgare, Hordeum vulgare subsp. spontaneum, Leymus cinereus x Leymus triticoides, Lolium perenne, Musa ABB Group, Panicum virgatum, Pseudoroegneria spicata, Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Triticum monococcum, Triticum turgidum subsp. durum, Zingiber officinale, Cenchrus ciliaris, Brachypodium distachyon, Zea mays, Triticum aestivum, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002845
species: Zingiber officinale
miRNA family: MIR167
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Zingiber officinale Zingiber Zingiberaceae Zingiberales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
 GATCATCTGGCAGTTTCAAT

mismatches: 0
bulges: 1
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pre-miRNA
 TTAAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAG
AAGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATC
TTCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGG
AAGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTAATTTATTGATCTATCAATTGTTTTCCTCTATCTGAAAGTCTAACAATGA
TTGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTTCCCAACAGAA


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR167c: 0.000000007

PMRD vvi-miR167a: 0.000000007

microPC miR167: 0.00003		UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 0.0000001		most similar mature miRNAs

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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