ABOUT THIS RECORDspecies: Centaurea solstitialis
miRNA family: MIR172
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Centaurea solstitialis Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GAAATCTTGTTGATGCTGCCA miRNA* TTAGTATCATTATTTTCTG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
AAGTTTTAAGTTATTGAACTTTCCATTGAGCATTTTATCTTTGTAAACCAGAAATCTTGTTGATGCTGCCAATATTGCTGCTTTGGCTGCTCTGTCTACA
TTCAGGAGGCCTGAATGTACATTTGGAGGAGAAGATGGTCAAGAAGTTATAGTAAATCCACCGGATGTGAGCTTCCTCTGCTTCCTTAATCCTTACTAAC
AAAGTCTTGGTGTTGGTTGATGTGATAGTCGACATTAATCTGCCTTTCTCATTGCCGTTGCCCCTTACTTAGGCCTGTCGTGAAACTGAAATATCACAAG
CTTTTGAAATATCACCTGGTTAGTGAAGCTATATAGTGTGGTACCAAAAGCTTTTGTGGAACCTACGGTTTTTGAATGTTTGAATATATTCATCTGATGA
TCCCCTTTGTAGCACAGTAGCACCCCAAGCTCTAAGCTGCAGTCTGGCCTAATAACCTCAAAATCAACTTAAATCCATGGTGGAAGTTACTGGTATCCCA
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dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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