ABOUT THIS RECORDspecies: Helianthus annuus
miRNA family: MIR167
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Helianthus annuus Helianthus Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAAGCTGCCAGCATGATCTG miRNA* GGTCATGGTTGCAGCTTCAAT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTTTATGTTTGTATGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGATAATGCCAAACTGATTTGCCTATGTGTTTTTGTGTCATGGTTTCTAGTGTGTATGTA
GATTAACTGTGTCTTGTGGGGTGTTCTAGTGTGTGTGTGTGTTTTCATGGTGTATCCAGTGTGTGTGTTTATGGGTAGGGTAAAGAAAGGTTAATCAGGT
CATGGTTGCAGCTTCAATTACTCATTACCAACAGTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR167c: 0.0000000008 PMRD ppl-miR167b: 0.00000005 microPC miR167: 6e-23 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 0.000000004 | most similar mature miRNAs |
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