ABOUT THIS RECORDspecies: Picea glauca
source: PMRD, original name: pga-miR172
Taxonomy by NCBI:
Picea glauca Picea Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGAATCCTGATGATGCTGCAC miRNA* GCTTATGCAAGACGAGGCTTCCAACTTGTCACGTGAAGATCAACCTAGTGACAAGTTCAATGAG mismatches: 11 bulges: 210 |
pre-miRNA
GCTTATGCAAGACGAGGCTTCCAACTTGTCACGTGAAGATCAACCTAGTGACAAGTTCAATGAGTGGTCACTGGGTTTTTTCCCGTAAGTGTTAATCAAA
GCTGGTGCTGTTGCTGAATGCAAAATATTCTTTGTCTGCATTAATGCAGGCTGGAACAAGAAATGAAATCCCCTTTTCTGCAGCCATTCTGGAGAAGGAC
TAGTTGTTGAAGAATATATTTGGGGTGAGAATCCTGATGATGCTGCAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR172f: 0.000003 PMRD psi-miR172: 0.00000000005 microPC miR172: 0.0002 | UniProt no hits RFAM mir-172: 0.00006 |
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