ABOUT THIS RECORDspecies: Dioscorea alata
miRNA family: MIR869
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Dioscorea alata Dioscorea Dioscoreaceae Dioscoreales Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CATGGTTCAATGCTGGTGTGA miRNA* ATCCTAGTATTTCCATAAA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TTACTCTAGAGCAGAATTCATCGACGAGGATGGTGAGCTTTCATGGTTCAATGCTGGTGTGAGAGTTGGTGTGGGTATCGGCCTTGGAGTCTGCGTAGGC
GTTGGCATCGGCGTCAGTTTACTTATTCGAACATATCAAGCAACCACTCGGAACTTTAGACGACGGCTCATTTGATGCCGAGACAACTAGTTTTATCATC
CTAGTATTTCCATAAAGCAGCTAACTTTGTGTTCTCTTTCATGGAGTTTGTTCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD gma-miR869: 0.0000000002 microPC no hits | UniProt sp|Q8GUH2|Y1015_ARATH: 0.0005 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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