ABOUT THIS RECORDspecies: Euphorbia esula
miRNA family: MIRf1211
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GCTGAGCAAATTTACTTTGGA miRNA* TCAAGTTACTTTTTGTTTAGCAT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
CTCTTACTTCAGCTGAGCAAATTTACTTTGGAGTTGGGCATTAGAATGGACTTTCATGGCAAAACCAGTGAGGAAGGTGCTGCTTTTCAAAGCTTTCATA
TTTTTGGGGCAATTCATCTGGTTGTACAGAGCTGATAAGTGAATCATTTAGTCCCACAAATTGAATGTTGTATATTCATTATTATTAGAAACAAATTCTC
CTACAGGCCATTTCAAGCAAAATAGATACAGTACATCAAAGCTCTCTCTCCCTCTGCAAATTCAAAGTTGATTTTTATTTCTCAAGTTACTTTTTGTTTA
GCATTAGTCGTT
dot-bracket secondary structure
...........((((((((((...((((.((((.((((.(((((..((((.((.(.(((.....)))..((((.(((.(((((((....)))).((((.(
(((.((((((...(((((((......))))..)))((((((...)))))))))))).))))))))((.((((((((.(((.((.((.((((.....(((.
....)))...)))).)).))))).))))...)))).)).)))....))).)))).).)).))))...))))).)))).)))).)))).....))))))))
))..........
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
CTCTTACTTCAGCTGAGCAAATTTACTTTGGAGTTGGGCATTAGAATGGACTTTCATGGCAAAACCAGTGAGGAAGGTGCTGCTTTTCAAAGCTTTCATA
TTTTTGGGGCAATTCATCTGGTTGTACAGAGCTGATAAGTGAATCATTTAGTCCCACAAATTGAATGTTGTATATTCATTATTATTAGAAACAAATTCTC
CTACAGGCCATTTCAAGCAAAATAGATACAGTACATCAAAGCTCTCTCTCCCTCTGCAAATTCAAAGTTGATTTTTATTTCTCAAGTTACTTTTTGTTTA
GCATTAGTCGTT
dot-bracket secondary structure
...........((((((((((...((((.((((.((((.(((((..((((.((.(.(((.....)))..((((.(((.(((((((....)))).((((.(
(((.((((((...(((((((......))))..)))((((((...)))))))))))).))))))))((.((((((((.(((.((.((.((((.....(((.
....)))...)))).)).))))).))))...)))).)).)))....))).)))).).)).))))...))))).)))).)))).)))).....))))))))
))..........
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
