ABOUT THIS RECORDspecies: Triticum aestivum
miRNA family: MIR1123
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triticum aestivum Triticum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCCGTGAGACCTGGTCTTATA miRNA* TGAGACCAAGTCTCATATAAA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGCCAGTGGGAAAAAAATTATATGAGACCAAGTCTCATATAAATCAGGTGAGACCCGCCTTGATGAATGACAGGTGGCATTCACCCCTGATATCAGGTGG
GGGGTGGGGTGAATGATCTGTGATTTGTGAATGTCACGTGTCATCCATTAAAATGGGTCTCACCTGCTAATCCGTGAGACCTGGTCTTATAGAATTGTTT
TCCATGCCAC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1123: 2e-38 PMRD tae-miR1123: 2e-38 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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