ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIR2610
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGATTGAGACTTGTATGGCTT miRNA* ATCATGTAGGGCTTTGTCTTT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTGCCGAAGAAAGTGTAGGTAAGATTGAGACTTGTATGGCTTCGTTGAAAGACGCCTAGAGGGTAATTCAGGAAGGCAAAACCGAAGGCTGAGGTCAGCT
AGTGGAGTAACATAGAACAAACGCAAAGAGGGAATTGGTTTTCCTAACAGCAAGCCTAGGATGTTCGACCCTACCAAAGGCTCATTCCACAGTGCCGGAT
TCATCCATGATTCGCCAGAGACCAATGGAATTACAGACGATGCACCTGAAGGTGTGGCACCTATCTTTGTGACACCTGGAGGAGCCTGCTGCAACTAGAT
TGTGGTAGACATTCCTTCTGCGATACCCCGTTCTAATTAATATGTTGGTCTTGTCTTTTGTCTTTTTTGCTTTTAAGAAAACTCCTTTCGTCCTGCCCAA
GACGAAAGTGAAATCATGTAGGGCTTTGTCTTTGCTTCCAATACTTTTATT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase mtr-MIR2610a: 5e-108 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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