ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIR2673
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCT miRNA* GAAGAGGACGATGAAGATGAG mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGGGNNGAGGAATANAAGAAGANACAGAAGAGGAGAGACAACCGCAGGAACAGAACAGTGACGAAGAGGACGATGAAGATGAGAAAGAACTTTTCAATGG
CAGTCGAATTCACGACCTAAATGCTTCACCAACCCTCAACAAGATTCATCGAGCTTCGGTCACGTACCAACGACGACCTCCCTCTCGAGGTAACTGGTCA
AGAATCCAATCAGTTCAACCAAGAGAAAGGCCTTCCATGACTAACCCACTCCCGCCTGGTGAGGATCCGCAATCACCAGCTGCTCCAAGAAAACAAACCA
TGTCACCAATGGCAGGAGGACCGATGCCTGGACTTGGTGCTTTTGACCCAACCGCCGTTAAACTTAAAGCGGCTCACCGGCCAACCGTCACCGGCGCCAC
CGCCACTCCTCCTGCTGGCGTCTTTGTTGCACCACAACTGAGGAAAGTGAACCGAGAGGAGAGGTCTGGAAGCGCCGTCGCATTGACCTTCAACAACAAC
AACGTTCCTCCTCAAGAAAGAATTCCTCAACCATCTCCTCTTGAAAAAAGGCGCTCTGCAGAACTTCCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTT
CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCG
dot-bracket secondary structure
((((..((((((.....(((((....(((((((((((........(((((.((((.((.((.((((((((.((.(((((.(((...(((.((((((..((
((((((......)))).....))))((((((..............((((.((((((.((((.(((....)))..))))....((((..((((((((((..
........)))))))..)))..)))).))))..)).))))................))))))(((...(((.........))))))..((..........
..))......((((((((((..((((..(((...(((((...(((...)))..((((((........)))))).))))).)))..))))...((((....
))))..))))))))))(((((((((((((.....)))).((((((.((..........((.(((((.....(((....)))...))))))).........
.)).)))))).((((((.(((............)))..))))))..))))))))).)).)))).))).))).))))).)).)))))))).))...)).))
.)).)))))....))).)))))))).)))))...))))))..))))....
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record
GGGGNNGAGGAATANAAGAAGANACAGAAGAGGAGAGACAACCGCAGGAACAGAACAGTGACGAAGAGGACGATGAAGATGAGAAAGAACTTTTCAATGG
CAGTCGAATTCACGACCTAAATGCTTCACCAACCCTCAACAAGATTCATCGAGCTTCGGTCACGTACCAACGACGACCTCCCTCTCGAGGTAACTGGTCA
AGAATCCAATCAGTTCAACCAAGAGAAAGGCCTTCCATGACTAACCCACTCCCGCCTGGTGAGGATCCGCAATCACCAGCTGCTCCAAGAAAACAAACCA
TGTCACCAATGGCAGGAGGACCGATGCCTGGACTTGGTGCTTTTGACCCAACCGCCGTTAAACTTAAAGCGGCTCACCGGCCAACCGTCACCGGCGCCAC
CGCCACTCCTCCTGCTGGCGTCTTTGTTGCACCACAACTGAGGAAAGTGAACCGAGAGGAGAGGTCTGGAAGCGCCGTCGCATTGACCTTCAACAACAAC
AACGTTCCTCCTCAAGAAAGAATTCCTCAACCATCTCCTCTTGAAAAAAGGCGCTCTGCAGAACTTCCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTT
CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCG
dot-bracket secondary structure
((((..((((((.....(((((....(((((((((((........(((((.((((.((.((.((((((((.((.(((((.(((...(((.((((((..((
((((((......)))).....))))((((((..............((((.((((((.((((.(((....)))..))))....((((..((((((((((..
........)))))))..)))..)))).))))..)).))))................))))))(((...(((.........))))))..((..........
..))......((((((((((..((((..(((...(((((...(((...)))..((((((........)))))).))))).)))..))))...((((....
))))..))))))))))(((((((((((((.....)))).((((((.((..........((.(((((.....(((....)))...))))))).........
.)).)))))).((((((.(((............)))..))))))..))))))))).)).)))).))).))).))))).)).)))))))).))...)).))
.)).)))))....))).)))))))).)))))...))))))..))))....
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record
