ABOUT THIS RECORDspecies: Crassostrea gigas
miRNA family: mir-184
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Crassostrea gigas Crassostrea Ostreidae Ostreoidea Ostreoida Pteriomorphia Bivalvia Mollusca Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGGACGGAGAACTGATAAGGG miRNA* GGTTGGTTTCTATCTGCT mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GGGTGGACGGAGAACTGATAAGGGGAAGTTACGCCGGGGATAACAGGCTAATCCTTTAGTAGAGTTCGTATTGGCTAAAGGGATTGGCACCTCGATGTTG
AATCAGGGATAATAGCTTCAAGGCGTAGAGGCTTTGAAAGTAGGTCTGTTCGACCTTTAATACCCTACGTGATTTGAGTTCAGACCGGCGTAAGCCAGGT
TGGTTTCTATCTGCT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase rno-mir-184: 0.00004 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM mir-184: 0.0008 | most similar mature miRNAs |
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