ABOUT THIS RECORDspecies: Haematobia irritans irritans
miRNA family: mir-1322
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Haematobia irritans irritans Haematobia irritans Haematobia Stomoxyini Muscinae Muscidae Muscoidea Calyptratae Schizophora Cyclorrhapha Eremoneura Muscomorpha Brachycera Diptera Endopterygota Neoptera Pterygota Dicondylia Insecta Hexapoda Pancrustacea Mandibulata Arthropoda Panarthropoda Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GATGCTGCTGCTGTTGCTGTT miRNA* CTTTACAGCAGCAGCATTTG mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTTAACGGAGCCTGTGAATGTTGTTGCGGATGATGCTGCTGCTGTTGCTGTTGTATGATATGGACATGCGGCTGAACGTAATTAACTTGGTTATAGCCTT
GGATCCCGGGCGCAATGTATAGACCGCCAACCGTAGCTGCTGTCCCAAGTCTTAACTTTACAGCAGCAGCATTTGCTGCAGCAGCAATTACAGCTGCATT
CTC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ptc-miRf10957-akr: 0.0006 microPC no hits | UniProt no hits RFAM mir-598: 0.0007 | most similar mature miRNAs |
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