ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
miRNA family: miR824
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCTTCTCATCGATGGTCTAGA miRNA* TGATCCTTGAGGAGTTAGGTC mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
CTCGTTTTTTTTTTTGTCAAACCACTTCTCGTTTAAAATGTGTTACTTCTTCCATCAAAATCTGATCCTTGAGGAGTTAGGTCCATAAGTAAGTACACAG
AGTGAACACATAACTTGATAAAATCATTTACACTTTGGACAATTTCCCATGAGATGCCAAACTTTTCAATGGAGTTTGAGTTTTTCAATGATAGCTAAAA
TTTGTATCTAGCACTACTTATAGCTACACTAGTATACTTGATAATATTTTGAGAGGAGTGGGGGAGATGCTGTGTTATTATTCCCTTCTCATCGATGGTC
TAGATGTGTGAGGTGACTCTCATGGAAGTAAAGGGAAATGGTGATTTATAGGAAAGCATCCAC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR824: 6e-21 PMRD bra-miR824: 6e-21 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR824: 1e-19 | most similar mature miRNAs |
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