ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
miRNA family: MIRf917
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GCTCTCTCTCTTCTGTCAAAT miRNA* GGCATGGATGGATGGCCA mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GCATATGGTTGGTGGCATGGATGGATGGCCAGTGACAAGTGTCTCCAAGCAGGTATCTGGAAATCAAACCACTGTCACAGCAAGGCATCTTCCTCAGCCAC
TATGGCAAAACCACTCTCAGGATCCTCCACCTGATCGTTACCTTCAGTGTTCAACAGCTGGGACTGGTTTCTCTGGTCCTGGAATTCCTTGTGGAGGATG
CTTCACAGGAGTTGCTGAACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAACCATGG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase far-MIR529: 2.0E-7 PMRD gra-miR157d: 6.0E-11 microPC miR157: 5.0E-5 | UniProt no hits RFAM 6mir-156: 0.001 | most similar mature miRNAs |
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