ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
miRNA family: MIRf917
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GCTCTCTCTCTTCTGTCAAAT miRNA* GGCATGGATGGATGGCCA mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
CATATGGTTGGTGGCATGGATGGATGGCCAGTGACAAGTGTCTCCAAGCAGGTATCTGGAAATCAAACCACTGTCACAGCAAGGCATCTTCCTCAGCCAC
TATGGCAAAACCACTCTCAGGATCCTCCACCTGATCGTTACCTTCAGTGTTCAACAGCTGGGACTGGTTTCTCTGGTCCTGGAATTCCTTGTGGAGGATG
CTTCACAGGAGTTGCTGAACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAACCATGG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase far-MIR529: 0.0000002 PMRD gra-miR157d: 0.00000000006 microPC miR157: 0.00005 | UniProt no hits RFAM mir-156: 0.001 | most similar mature miRNAs |
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