ABOUT THIS RECORDspecies: Cucumis melo subsp. melo
miRNA family: miR168a
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Cucumis melo subsp. melo Cucumis melo Cucumis Cucurbitaceae Cucurbitales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT miRNA* TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTTCTTTTTGGTTCAGTCATCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGTTTCGCTTTTTGTTCACGTTGATCTTGATTGTTGTTGTTTCT
TTCAATTTCCTCTGCGTTGTTCAGGGGAAATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTAATCGAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCCGAGACAG
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase crt-MIR168: 0.00000000000001 PMRD rco-miR168: 8e-16 microPC miR168: 5e-54 | UniProt no hits RFAM MIR168: 0.00000000000001 | most similar mature miRNAs |
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