ABOUT THIS RECORDspecies: Euphorbia esula
miRNA family: miR169l
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGCAGTCTCCTTGGCTATGCT miRNA* GGTAGCCAAGGATGACTTGCCCG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCC
TAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATT
ATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGG
CTCCATCTCTTCT
dot-bracket secondary structure
)....(((((((.((((((((..(((((((.(((((((.(((..(((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((((.(((((....))))).))
)...(((.((((..((.((((((..((((((.((........)).))))))..)))))).))..)))).)))(((((((((...))))..))))))))))
)))....((((((.((((......)))).))).))).......)))))...))))))))))))))))))))...)))))))))))))).)))..))))))
))...))))))).
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
TGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATCC
TAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTATT
ATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAGG
CTCCATCTCTTCT
dot-bracket secondary structure
)....(((((((.((((((((..(((((((.(((((((.(((..(((((((((((.((((.(((((.((((((((((((((((.(((((....))))).))
)...(((.((((..((.((((((..((((((.((........)).))))))..)))))).))..)))).)))(((((((((...))))..))))))))))
)))....((((((.((((......)))).))).))).......)))))...))))))))))))))))))))...)))))))))))))).)))..))))))
))...))))))).
SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR169v: 7.0E-11 PMRD ptc-miR169v: 7.0E-11 microPC miR169: 0.0003 | UniProt no hits RFAM 5MIR169_5: 8.0E-11 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
