ABOUT THIS RECORDspecies: Guizotia abyssinica
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Guizotia abyssinica Guizotia Millerieae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCTACCATTGCCTACATTAT miRNA* AATGGGTGGAGGTCGAGCC mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
GTCTCACTCTTCTGAATCCGGAAATGGGTGGAGGTCGAGCCCCGTTAAATCGAGGTTACAGTTTGCAGAAAATTCTTCCTGACTCTATAACCAAAGTGTA
CAAAGTAACAGATTTTTGGCGCGTGAATTTTAGACTTGCAGCACTGTTCATTACGGACCTGTTATCTGCATATGCAATATATGTGATGATGAACTATTTA
ACAAATGTCTGGAATTTAAGCATTACACGGGGTGCTGCTATCATAAACATTTGGGATGGAATCACATCGGCTTTGGTCATTGTGCTTGCCTTTTTTGTTG
ATGCCTTCTTGGATGCCTTCTATATGGTTGTACTCTCTACCATTGCCTACATTATCGGATTTGGATTATTGTCC
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|O80436|PTR29_ARATH: 0.0002 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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