ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIR157
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC miRNA* GCTCACCCTCTCTCTGTCT mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAGCGGCAGGCTACGTCTGATAAGAGCATGGTTAATAGTATAGCCAACTGCTGGCTATAAGCATCTTTATAGCTC
ATCTTATAGCTGGCTTGTACAATAGTTAGCTGTAAAAGAGTACTACTTTTATCATATATGGCCTACCTTTCATTCTCACAAAGCACCTATGAGCACGTGC
TAGAGCCGGCTCTTCACGAAGAGCCCGCTTCCCTTCTCTCTCCTCTTCTCTCTCATCCAACTCAGCAAANATATAGTATTTTAATCCTTACAGCCTGCTG
ACTGTACCTTATTGTACTTGCTCTAAAGAGGACGGATGGATGCGAAGAGAGAGAGAGATAGACGCAGCTGCTGTTGCGTGCTCACCCTCTCTCTGTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase hvu-MIR156: 2e-39 PMRD hvv-miR156a: 6e-166 microPC miR156: 0.000001 | UniProt no hits RFAM mir-156: 0.0000004 | most similar mature miRNAs |
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