ABOUT THIS RECORDspecies: Ipomoea batatas
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ipomoea batatas Ipomoea Ipomoeeae Convolvulaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCTTTC miRNA* ACATTGATGTGATGATGAAG mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGGATGAATCTTCATCATCATCATCATCTTTCTCATTGCGCCAACAATAATCCTTCTGATTATTGGACCCTTCAAGTTTAATTCTTCGACCAAANACCCA
CCACCTTTCTCTCTCTGCAGGAAATTCTTGAGGAGTGTCACAGATTCAGAGGCGGGGATTCTTGGGAAAATCTTGTTTTATTGGAGAGAAGTGAAGAATT
TGGAGGCTGAGAAGCTGAGGAAATGGATAGTAAGCAGATTGAGAATGGATTACTATGAAGCTTCCCTTTGTACAACTTCTTTGGTCACTACTTTTGGGCG
CCCTTCAGCATTTCGATTCAGGGATTGTTATGAGTACATTGATGTGATGATGAAGAGTGATAG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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