ABOUT THIS RECORDspecies: Jatropha curcas
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Jatropha curcas Jatropha Jatropheae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACATCATCATCATCTTCTTCT miRNA* GAGAATGATGATGATGAACAGA mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
CTTCAATTCTCTACATCATCATCATCTTCTTCTTCTTCTGCTTATAACACTACCCCTCCTTTCACTGTTTCTACTTGTTCTGCCTCTGCTTCTTCCTCTGT
TTCGTCTTTCTCATCTTCTGCATCTTCAAGACTTTTGTTTCCTTTTGCATTTGAAGGATGTAATAATCAACCTATCCAATTTCCTCACCAATTTAAAACA
AACCCTTCTTTTCCTTATTACCGTCCAACAATACAAAATCAACAACAAATGATTTCTTTTAATCAAAGCCAGCAACAGAGCATCACTAATCCTCTGTTTT
TCGCTGGAGAATCTGCATTAGCCCACCACCACCAACAACAGCAACAGCTTTTTCAATATTGGAGTGATACATTGAACTTAAGTCCAAGAGGGAGAATGAT
GATGATGAACAGAGCAGGCCC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ghr-miR414f: 4.0E-7 microPC no hits | UniProt sp|Q9M0J3|ERF54_ARATH: 0.0007 RFAM 8mir-598: 7.0E-6 | most similar mature miRNAs |
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