ABOUT THIS RECORDspecies: Lactuca perennis
miRNA family: MIR164
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Lactuca perennis Lactuca Lactucinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGGAGAAGCAGGGTACGTGCA miRNA* CATGTACCCGTCTTCACCATC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAATACGAGGTTTATAAGGTAGGCGCACAAGATGGAGAAGCAGGGTACGTGCATTACTAACTCACATGGAAATTAAAACCAGCACTTGGATATTTTTTGAC
CTTATTAAAACTGCTGGGCCTTTGATAAACTGTTACTCAACATCTTTAATTTGTAATGTAAATTTGGTCTTTGGAACCCTAACCATAGCTGTGAGTTTAT
GTTTGATAAGAAAGGTAGTGTACTAGTGTGTTTAGAAGTCGAAGCCATATGCGACTAAACACACCGGGTACACACATTTGTTCTCTTTGATAAACTTGTG
CAAAGGGCGTTTGGGTGTCATAACTAAAGCATGTGTATGTACGTTCGATTTAAAAGACCTTTCGTAGTTTCATCAGAACGTGCGTACATTGAAAACACTT
TTTGTAGTGTAATTGAAGGTAAATGAAAATTTGTAACGATTGAATATCCTCTTCCAAAAGTCTCTGATCCGCCATTGAATGAGTTGGTGATTCATGTACC
CGTCTTCACCATCTTGACCACCTAAACCTTAATGTTGAAGA
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR164e: 3.0E-11 PMRD ptc-miRf11320-akr: 3.0E-11 microPC miR164: 8.0E-9 | UniProt no hits RFAM 4MIR164: 6.0E-10 | most similar mature miRNAs |
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