ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTCGTCTCGCAGTTTACAGG miRNA* TGTAAATTGTGAGACGAATCT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAAAAACCAATTGCACAGTTCGCGTGTAAATTGTGAGACGAATCTTTTAAACCTAATTGCGTCATGATTTGACAATGTGATGCTACAACAAATATTTGCT
AATGATGGATTGATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGAATCTATAATTTGTTTTGTTATTAGT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124a: 6e-50 PMRD osa-miR442: 4e-48 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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