ABOUT THIS RECORDspecies: Parthenium argentatum
miRNA family: miR3441.2
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Parthenium argentatum Parthenium Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGAAGAAAAAGAAGTCGTTGA miRNA* AACTCTCTTTTATTTCTTGTTTC mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
AACAAACCTTTAATTTCATTTCCCTACTAAATAACTCTCTTTTATTTCTTGTTTCTTTTTTGCGTTGATCATATCATGTCTAACGAAGCAGTTTACCACC
ACGCCCCGAAAACCGAAGAGCCTTGCGAAACAACCACCACCACAGTGAAGGTGGAGGAGCCTGAGACCGTGGAGCATTCAGACCGTGGGTTGTTCGGTTT
CGGGAAGAAGGAGGAGGAGGAGAAGAAGTGCGAAGATGCGGTGATCTCGTCCGAATTTGAACAGAAAGTTCAGGTTTCTGAACCCGAACCGAAATCAGAG
GAGAAGAAAGAAAGCTTGCTTGATAAACTTCACCGATCTAATAGCGGCTCCAGCAGTTCTAGTGACGAGGAGTGTGAGGACGGAGAGAAGAAGAAGAAAA
AGAAGTCGTTGAAGGAAAAGATTGAAGGGCACAAAGAAAAG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ptc-miRf12467-akr: 0.000001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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