miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse
Home
Browse miRNAs
Deep-seq predictions
Mirtrons
miRNA genes
Degradomes
Download
Upload
Contact
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST001914
species:
Phaseolus acutifolius
miRNA family:
MIRf385
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius
Phaseolus
Phaseoleae
Papilionoideae
Fabaceae
Fabales
fabids
rosids
core eudicotyledons
eudicotyledons
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GTTCAGGTTCGGGTTCGGGTT
miRNA*
CCCGAACCCGAACCTGAACCC
mismatches:
0
bulges:
0
View larger
pre-miRNA
GAAGCGCGACGCCGAGTTCCGTCTCGAGCGTCTCCGCACCGCTCGAGGTTTAGAACCGAAGCTTCCCCCTACCGAA
CCCGAACCCGAACCTGAACCC
AAA
CTCGAGCCCGAGCCTTCTTCCGACGCTGGCCACATCAACCCCATCTCAGACTCTAAACTACAATAAACTTCAGATATTGTATGGTAATGATGGGGAAACT
CTTGAAGCAAAACAGAAAAAGAAAACCCAGAATATTATGTTCATCTGGAGACCCTCCTCCTACTGCCAAAAACATCTCTGTGACTCTGCATCTTCTCGTG
TCTCAAAGCCCTCTCCCGGTCCTTCTCTCTTCTTTCCCTYTTCATTCTCTCTTCCCTCAATTCCTCCATCGTCTTCCTCTTCTTCTCACCCTTATTCTCT
CTCCTATCGCCGTCACCACTTTCATCCTTCACAACATCATCATCATTAGGTTTCCGAAGATACCACGGCAACTTAACCCCCTTTCCTGCAAGCCCGTAAC
CAAGCCTATACTTCTCATCCTCCGGGCCCACAACAACGGCGGGCTTGGGCCCTCCCTCCTCCCTTTTCTTCTTCTTGGCAGGGGGACCCTCTTTCTGAGG
CCCCTGAATTGGGTCAAAAATCTTGATCCCTTCGAAGAGGTTGATGTGGCCAGCGTCGGAAGAAGGCTCGGGCTCGAGTTTGG
GTTCAGGTTCGGGTTCG
GGTT
CGGTAGGGGGAAGCTTCGGTTCTAAACCTCGAGCGGTGCGGAGACGCTCGAGACGGAACTCGGCGTCGCGCTT
dot-bracket secondary structure
.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
(((((((((((((((((((((
(((
(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((......(((((((.........))))))).)))...)))))))...((
(((...((.....((((.(((((((...((((....((((((((..(((((.......................)))))))))....)))).)))).(((
....((((........((((................................................................................
........))))......)))).......)))..((.........(((((((.(((.........))).)))))))..........)).((((((((...
...((((................))))...........))))))))(((...........)))))))))).))))..)).(((((..((((.....))))
)))))(((..(((((((.....))))))).))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
)))))))))))))))))
))))
)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
no hits
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
most similar mature miRNAs
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record