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ID:
MNEST002658
species:
Solanum melongena
miRNA family:
MIRf751
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum melongena
Solanum
Solaneae
Solanoideae
Solanaceae
Solanales
lamiids
asterids
core eudicotyledons
eudicotyledons
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
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Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GATCCCTTTGGATGCCTCCTT
miRNA*
GGAGGAGTCCAAAGGGATAGC
mismatches:
2
bulges:
0
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pre-miRNA
GTAGCTCCAAAA
GGAGGAGTCCAAAGGGATAGC
ATGATCCAATTCAATATTTTTTTTATGTAATAGATTATATGTTGTTTGGATACTTCAAAATTATGCA
CAATACGTGTTGAATCCTTCAAAAGAATAGTATATTTTTAAAAGATCTAATCGATACAGGCCTGACAACATTTTGGAGAGTTCAAGCAACATAATAAATA
GAAAGTTATATTACTTGAACTCTCACAAAAAAAAATATTATTGTATCCATGTTAAACCTTCCAAAAATACAATATCTTGAAGAATTTAACATGTACCTGT
CGATATTCTTGAAAAATCTGAACAACGTATATAGAGATTGGATCAATGC
GATCCCTTTGGATGCCTCCTT
AAGTTGCTT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
mtr-MIR393
:
0.000000000005
PMRD
mtr-miR393
:
0.000000000005
microPC
miR393
:
0.00002
UniProt
no hits
RFAM
no hits
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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