ABOUT THIS RECORDspecies: Taraxacum kok-saghyz
miRNA family: miR166g
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Taraxacum kok-saghyz Taraxacum Crepidinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG miRNA* TCGGACCAGGCTTCATTCCCC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGA
TATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATC
GCTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR166a: 0.0000000002 PMRD ptc-miR166a: 0.0000000002 microPC miR166: 0.0000008 | UniProt no hits RFAM mir-166: 0.000001 | most similar mature miRNAs |
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