ABOUT THIS RECORDspecies: Taraxacum kok-saghyz
miRNA family: MIR393
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Taraxacum kok-saghyz Taraxacum Crepidinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCCAAAGGGATCGCATTGATC miRNA* TCATGTGATGTCTTTGGAAG mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
CCACTAGATTTGATTATGTTGCAGCAGGCGGAAGCTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGGTTTATTAGATGATGTGATTCATTCGTATTTGTTTCAGGATT
ATCCATCCATGGAAGCAACTCGATCTGAGATGATAATTAATAATTTGGATCATGTGATGTCTTTGGAAGTTTCCGTCAGTGTTTGCATTGATCTATCCAT
C
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR393: 2.0E-7 PMRD sbi-miR393: 2.0E-7 microPC miR393: 3.0E-9 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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