ABOUT THIS RECORDspecies: Centaurea maculosa
miRNA family: MIR394
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Centaurea maculosa Centaurea Centaureinae Cardueae Carduoideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGGTGGACATACTGTCAACGG miRNA* TTGGCATTCTGTCCACCTCC mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTCAATTCATGGCGGTTTAATAAAGGGTTTCCTGCAGATTTCTTTGGCATTCTGTCCACCTCCCTATTCATGTATCAAACCCCACTATAGGAAAAGCTAAA
AAGAAAGAAAAAGAAAAAGAAACCCGTGTGTGTAATTAGGGTTTCGTAGTTTGCTAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAGAATCTAAGGCAAGATTTTTT
CTTTTGTGTGTGTAATTAGTGTGTGGAGGTGGACATACTGTCAACGGAGCTCTGTTGGTATCTCTTTGTAAAACCCTCTTGAAGTT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR394b: 4.0E-15 PMRD ptc-miRf10096-akr: 1.0E-9 microPC miR394: 6.0E-5 | UniProt no hits RFAM 4MIR394: 2.0E-5 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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