ABOUT THIS RECORDspecies: Artemisia annua
miRNA family: MIR1530
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTTCACATAAGTTAAAATTC miRNA* TTTTTATTTTAAGTGTAATTT mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
CATCATGCAACATTTCACATAAGTTAAAATTCTAGCAAGTTGCTTTACAACCGTTAAAAATATAAATATTAATGAAAGTGGATCAAAAGCAGTCACGAGT
AGTGATAATAATCCAAGTGAATATTGGTTAACAGATTAGGCTGGTAGTAATAGCGTTTTACTTGACTGAGTCATTGCCGATGTGTCACCCAAAGAGACTA
GTCCCCTTATTACATTTGTTGTACACGACTCCGTCGTCTAGGTAAGAAAAGGAGAAGTGGGTCAGTCAAGTGACCTATTTGTATGCATGTTTGTGTATGT
GATTTTTATTTTAAGTGTAATTTTGTAGGGT
dot-bracket secondary structure
.(((.(((((.(((.(((.((((.(((((.((..((...(((.(((((...((((((...........))))))...))))).)))..)).(((((....
.)))))..(((.((((.......)))))))(((...(((((..(((..(((((.(((..((((((((((.(((((.((......(((((...((((((.(
(((....(((.((....)).)))...))))..))).))).)))..))...))...))))).))))))))))))))))))....)))..)))))....)))
)).))))).)))).))).))).))))).)))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
CATCATGCAACATTTCACATAAGTTAAAATTCTAGCAAGTTGCTTTACAACCGTTAAAAATATAAATATTAATGAAAGTGGATCAAAAGCAGTCACGAGT
AGTGATAATAATCCAAGTGAATATTGGTTAACAGATTAGGCTGGTAGTAATAGCGTTTTACTTGACTGAGTCATTGCCGATGTGTCACCCAAAGAGACTA
GTCCCCTTATTACATTTGTTGTACACGACTCCGTCGTCTAGGTAAGAAAAGGAGAAGTGGGTCAGTCAAGTGACCTATTTGTATGCATGTTTGTGTATGT
GATTTTTATTTTAAGTGTAATTTTGTAGGGT
dot-bracket secondary structure
.(((.(((((.(((.(((.((((.(((((.((..((...(((.(((((...((((((...........))))))...))))).)))..)).(((((....
.)))))..(((.((((.......)))))))(((...(((((..(((..(((((.(((..((((((((((.(((((.((......(((((...((((((.(
(((....(((.((....)).)))...))))..))).))).)))..))...))...))))).))))))))))))))))))....)))..)))))....)))
)).))))).)))).))).))).))))).)))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
