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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003001
species: Artemisia annua
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATACTCCCTCCGTCCCAAAAT

miRNA*
 TTTTGGACGGAGGGAGTGCGA

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 ATTAATATGTAAAATAATTCTTCTCAAAATTTTATTATAACTAGTGCATATTCCTTGTAACATACTCCCTCCGTCCCAAAATTTAAGTTCAGTTTGACTTT
TTTTAATCCAACTTTGACCTTAAATAGTTTCGGTTGTGTTATATAATATTTGATGCAAAATATATAAATGGATTGGATTTTAAATATATTTTCATATGAT
ATAATTTTCATCAAGTATTATGTAATAAAAGCAAAAATATTTATGGTCAAAGTTAGATTCAAAAAGTCAAACTGGACTTAAATTTTTGGACGGAGGGAGT
GCGAGATATGACTGATTAATAAATACGAATGGCTTAAGTGTGAAGAATAATTAAAATGTGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase tae-MIR1122: 8.0E-5

PMRD osa-miRf10218-akr: 2.0E-5

microPC miR1439: 8.0E-5		UniProt no hits

RFAM 2MIR1122: 9.0E-5		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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