ABOUT THIS RECORDspecies: Artemisia annua
miRNA family: MIRf469
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCTGCAATCCCAGCACTTTGG miRNA* AAGTGCTGGGATTACAGGCA mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTTTTGTTTTTTTGTACAGATGAGGTCTCACTATGTGGCCCAGGCTGGTGTTGAAATCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTGCTG
GGATTACAGGCATGAGCCCCCATGCCCAGCCTCTGAATCATTTTCTTTAGGTTAGCAAACTATTCGGCCAGATCTTTTAAATACATGAATGCTTTATTGC
TTTGTTTTCCTTTAACTCATTCTGTTCTCCACACTCATTTAAGGAGACAAGTCTGTTCATTTCTCCACCAGATACATTTTACTGTAGGATTTGGGAGTGA
CAAAGCCGCGAGTCATTTAAACAGCGGGGTTGCATGGCTCAGAAGAGTTGACTACTCACATAAGTCAGTGTATTGGCGGAGGAGGAAAAATACTCCTTTA
AATACGAGTAATAAAACAATATTAAAAGTAGACCAGGCTGGACGCAGTGGCTCATGTCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTAGATCACA
AGGTCAGGAGTTTGAGACTAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCACGTCTACTAAAAATACAAAAA
dot-bracket secondary structure
.((((((.((((((...(((((.(((.(((((((((((..(((((((((.(((((.((((((.((...((..((..((((.(((((((((((((((((((
(((((.((((((((((((....(((((((((...(((.....)))....((((.((..(((.((((((((((((((.....((.((((.(((......((
((((((.((((..((.((....(((.((((............))))))).(((((.............)))))(((......))).)).)).))))..))
)))))).)))..)))).))......))))))...)))))..))).)))(((((.........))))).((((((...(((((((........))))))).
))))))..(((((......)))))...)).)))).))))))..)))..)))))))))))).))))))))))).))))))))))))).))))..))))...
)).)))))).))))).))))))))).)).))))))))).)))...)))))..)))))).)))))).
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
TTTTTGTTTTTTTGTACAGATGAGGTCTCACTATGTGGCCCAGGCTGGTGTTGAAATCCTGGGCTCAAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTGCTG
GGATTACAGGCATGAGCCCCCATGCCCAGCCTCTGAATCATTTTCTTTAGGTTAGCAAACTATTCGGCCAGATCTTTTAAATACATGAATGCTTTATTGC
TTTGTTTTCCTTTAACTCATTCTGTTCTCCACACTCATTTAAGGAGACAAGTCTGTTCATTTCTCCACCAGATACATTTTACTGTAGGATTTGGGAGTGA
CAAAGCCGCGAGTCATTTAAACAGCGGGGTTGCATGGCTCAGAAGAGTTGACTACTCACATAAGTCAGTGTATTGGCGGAGGAGGAAAAATACTCCTTTA
AATACGAGTAATAAAACAATATTAAAAGTAGACCAGGCTGGACGCAGTGGCTCATGTCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTAGATCACA
AGGTCAGGAGTTTGAGACTAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCCACGTCTACTAAAAATACAAAAA
dot-bracket secondary structure
.((((((.((((((...(((((.(((.(((((((((((..(((((((((.(((((.((((((.((...((..((..((((.(((((((((((((((((((
(((((.((((((((((((....(((((((((...(((.....)))....((((.((..(((.((((((((((((((.....((.((((.(((......((
((((((.((((..((.((....(((.((((............))))))).(((((.............)))))(((......))).)).)).))))..))
)))))).)))..)))).))......))))))...)))))..))).)))(((((.........))))).((((((...(((((((........))))))).
))))))..(((((......)))))...)).)))).))))))..)))..)))))))))))).))))))))))).))))))))))))).))))..))))...
)).)))))).))))).))))))))).)).))))))))).)))...)))))..)))))).)))))).
SIMILARITIES| miRBase hsa-mir-5096: 2e-18 PMRD ptc-miRf12412-akr: 0.000002 microPC no hits | UniProt sp|Q96N38|ZN714_HUMAN: 0.000001 RFAM Metazoa_SRP: 5e-29 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
