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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003023
species: Artemisia annua
miRNA family: MIRf469
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCTGTAATCCCAGCACTTTGG

miRNA*
AAAGAGTTGGGATTATAGGTG

mismatches: 1
bulges: 0

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pre-miRNA
CCTGCCTCAGCCTCCCTAATAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCATTAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACGGGGTTTTTGCCATGTTGGT
CAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCTTCCCAAAGAGTTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCCAAAAGAAG
GATTTAAAAATACAGTATTATCATAATCTTGTAAAAAATTACTTGCAGAAAAGATGACTGGGAGTAATAAAACATTAGGCAAATAAGTATTTTTCCCTAA
AAATTCTACTTAACTTTTAAATTACAAAAGTAATACAGGCTTACTGTAATATATTCTGAAGACATAGAAAGAAAACATTGATGGGCCAGGCATGGTGGCT
CACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGAGGGCCAATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCCGTCTCTAC
TAAAAATACAAAACATTAGCCAGGCCTGGTGGGGGGTGCCTGCAGTCCCAGCTACTCCGAAGGTTGAGGCAGGAGAATGGCATG


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase hsa-mir-5096: 0.00000000000003

PMRD ptc-miRf12412-akr: 0.000000000002

microPC no hits
UniProt sp|Q8N2A0|CX062_HUMAN: 0.000000000000005

RFAM Metazoa_SRP: 2e-47
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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