miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Species belonging to selected taxon:

Barnadesia spinosa, Cichorium intybus, Gerbera hybrid cultivar, Guizotia abyssinica, Helianthus argophyllus, Helianthus ciliaris, Helianthus exilis, Helianthus paradoxus, Helianthus petiolaris, Helianthus tuberosus, Lactuca perennis, Lactuca saligna, Lactuca sativa, Lactuca serriola, Lactuca virosa, Parthenium argentatum, Taraxacum kok-saghyz, Taraxacum officinale, Zinnia violacea, Carthamus tinctorius, Centaurea maculosa, Centaurea solstitialis, Cichorium endivia, Artemisia annua, Helianthus annuus



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST003023
species: Artemisia annua
miRNA family: MIRf469
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCTGTAATCCCAGCACTTTGG

miRNA*
AAAGAGTTGGGATTATAGGTG

mismatches: 1
bulges: 0

View larger
pre-miRNA
CCTGCCTCAGCCTCCCTAATAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCATTAGGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGACGGGGTTTTTGCCATGTTGGT
CAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACTTCAGGTGATCCACCTGCCTCAGCTTCCCAAAGAGTTGGGATTATAGGTGTGAGCCACCATGCCCAGCCAAAAGAAG
GATTTAAAAATACAGTATTATCATAATCTTGTAAAAAATTACTTGCAGAAAAGATGACTGGGAGTAATAAAACATTAGGCAAATAAGTATTTTTCCCTAA
AAATTCTACTTAACTTTTAAATTACAAAAGTAATACAGGCTTACTGTAATATATTCTGAAGACATAGAAAGAAAACATTGATGGGCCAGGCATGGTGGCT
CACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGAGGGCCAATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACAGTGAAACTCCGTCTCTAC
TAAAAATACAAAACATTAGCCAGGCCTGGTGGGGGGTGCCTGCAGTCCCAGCTACTCCGAAGGTTGAGGCAGGAGAATGGCATG


dot-bracket secondary structure
(((((((((((((......(((((((((((.(((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((.....(((((((
((((.(((((((((.(((((((((((..(((((...(((.((((.(((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((..(((..(((.((
(((((((((((((..((((....((((.((.......(((((((.(((.........))).)))))))..)).))))....)))).))))))))......
))))))).))).((((((.......))))))..(((((.....))))).(((.((((............)))).......))))))..))))))))))))
)))))))))))))))))).))))))))))).)))).)))...)))))))))))))))).))))))))).)))))))))))....)))))))))))).)))
))))))))))))).)))))))))))))))))).))))))))).)))))))))))......)))))))))))))...........



SIMILARITIES
miRBase hsa-mir-5096: 0.00000000000003

PMRD ptc-miRf12412-akr: 0.000000000002

microPC no hits
UniProt sp|Q8N2A0|CX062_HUMAN: 0.000000000000005

RFAM Metazoa_SRP: 2e-47
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record





Liczniki na strone;