ABOUT THIS RECORDspecies: Brachypodium distachyon
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brachypodium distachyon Brachypodium Brachypodieae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATACTCCCTCTGTCCCTAATT miRNA* TTAGGGACGGAGGGAGTATCA mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
GCAGCTAATAAATACTCCCTCTGTCCCTAATTAATTGGTGTCGGCCTTTTTGCAAAACAACCCTTGTAAATTTTCGAAATAAACCTGCAGTCCATATCTT
CAATTAAATGTGGACAGCGAGTTAATTTCGAAAATTTACAGGTTTTTTTTGCAAAAGTTCCAATAGAACGTGGACTGCAGGTTTATTTCGGGAATTTACA
GGTTTTTTTTTGCAAAAAAGCCGACGCCAATTAATTAGGGACGGAGGGAGTATCAGGTGGTGG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR806: 0.001 | most similar mature miRNAs |
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