ABOUT THIS RECORDspecies: Zea mays
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Zea mays Zea Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTG miRNA* GAGCTCCTATCATTCCAATGA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GATGCTTTGGGTTTGAAGCGGAGCTCCTATCATTCCAATGAAGGGNNCGTTCCGAAGGGCTGGTTCCGCTGCTCGTTCATGGTTCCCACTATCCTATCTC
ATCATGTGTATATATGTAATCCATTGGGGGGAGGGTTTCTCTCGTCTTTGAGATNAGGNTTGTGGTTTGCATGACCGAGGAGCTGCACCGCCCCCTTGCT
GGCCGCTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTGCATCCTGATCCACCCCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR159a: 5e-119 PMRD zma-miR159a: 5e-119 microPC miR319: 1e-17 | UniProt no hits RFAM MIR159: 5e-95 | most similar mature miRNAs |
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