ABOUT THIS RECORDspecies: Ciona intestinalis
miRNA family: miR-4179
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ciona intestinalis Ciona Cionidae Phlebobranchia Enterogona Ascidiacea Tunicata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CACTTCATCTGGTATAAACTT miRNA* GCTTTTACACCAGATAAGTCGAA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
TTACAACGCATTATAAAATCTAATAGATTTTCACTTCATCTGGTATAAACTTTAATTTACATTTATTTCAGTGATATCACATACGTAGTGTTGTGGTGTC
AAACCTTGATGTATCTTGCTAAATGTCCGACACAACATTGGAATAAAATTAATGCTTTTACACCAGATAAGTCGAAAAAGATTATTTTATATTTTGCCTG
TTAG
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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