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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST007353
species: Solanum tuberosum
miRNA family: miR2928
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TAGAAGATGACATTTTGTTGG

miRNA*
AACAGAGTTGTCAAATTTCTCCA

mismatches: 3
bulges: 2

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pre-miRNA
AGAAGTAGAAGATGACATTTTGTTGGTGACTTTGGTCTCAAAAGAGTGCTTATCATTGTTTAGTTAATTTATTTACAGTATGTTATTTGTCTTATTTTAC
TTTAGTAAACTATTTATTGGAACCTATTTCAAAAATTAGTTTTTTTTAGTTGATAGTCTTTCGAAAACATATTTTATATCCAGCAAGAGGTAAGAATAAA
ATTTATATACATTCCATGACCCCATTTATGAGATCATATTGGATATGTTGTTGTTGTTTATTTCAGTAAATTGCTTACGTAGTATATAGTATTGTACCTT
AATTGAATGTTTGATGCATGTTTGATGCATGTTTGTGTGGCGGTGAAGCAATATTTGATCCTTTGTATGCAATAATATTTTTTTTGTTGAAGATCGTTCA
ACTGATCATCTTGAATCTAGCTAGTTTCTGTGATATAAAAGAGCCAATTTGTGGTTACAAAAGATAACCACCGTTTTTATATACTTCATATAATATTTGT
AAGAATGATCCTTGTTTTTTACTTTTTGAACTTAGAAATGATTTAGATGCTTTAATTTAAAATTTTAAGCATCTTGTAGTCTTGCTTTTTTGCATTATAT
GCCTTTTTTGCTGTAACATTTGTTCAAGAAATTTGCATTCTTGTACAATGGGAATTGTGAAATAATATTCGTAGGGAATATCCAAGCATTATTATCATCA
TTATATGCGACACATGGCATTATACTCTTGGGGACCAAAGTTCACAAACAGAGTTGTCAAATTTCTCCATC


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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