ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIR166
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGGACCAGGCTTCATTCCTC miRNA* GGGATGTTGTTTGGCTCGACA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TTTGTGTGTGGTGAGTTTGAGGGGGATGTTGTTTGGCTCGACACAATTACTCTCTTGTATGTGTTTATTTATTCGTCATCAAGATTGATGTTGATAACGAA
TAAATTAAACACAACAAGATATGTAAAAAGGGAGTAAAGGCGTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACAATATTCTACTT
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR166m: 9.0E-9 PMRD zma-miR166m: 9.0E-9 microPC miR166: 0.0001 | UniProt no hits RFAM 6mir-166: 2.0E-7 | most similar mature miRNAs |
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