ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIR235
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTAATGTGTTGTCTTTGTTAG miRNA* ACCAGTTTTAATATCAGTGGTT mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
GAGTAAGTATTTTGGATTTAAGTTAATTTAGCTAATGTGTTGTCTTTGTTAGTAAGGGGAGGTTTATGTTTGATGAAATTTTTGATAAATAAAGGGGAAA
ATTTTTAGAAAAATATAAAGAGGATTAAAGTGCGTTCTCCACCTCCTCTTAGTTTGTAATGAACTACCAGTTTTAATATCAGTGGTTGTGTTTGTGTCTA
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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