ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum tuberosum
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Solanum tuberosum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AATTGGGACAGAGGGAGTACT miRNA* TACTCCCTCCGTCCAATTTA mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTGTTTAAACAATACTCCCTCCGTCCAATTTAAGTGTCTTAGTTTGACTGAACACGGAATTTAAGAAGTAAAGAAAGACTTTAGAATCTTGTGGTCCTTA
AATTAAAGATGTGTGTAGTCATTTAATTGTTATGCTTAAACTTGCCATGTAATAATTGGAATTGAAAAAGTTACTAAATATAGAAAGAGACGCTCTTTTT
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.001 | most similar mature miRNAs |
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