ABOUT THIS RECORDspecies: Vigna unguiculata
miRNA family: MIR167
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Vigna unguiculata Vigna Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAAAGCTGCCAGCATGATCTG miRNA* GGTCATCTTGCAGCTTCAAT mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTCTTTTCACAAGTATGTTGGTTTGAGAGGTTAAAGCTGCCAGCATGATCTGGTAATCACCACACTCTTTTCCCTCATCTCATGCCTCATTTGAAAATCCA
TATCTACTCATTTTTTGGTTCAAATTCAAGGTTTCTTTCTGGTGTCAATCACTTCTGAAAAAAAAAAAAAGAAAAGGTTTTAACTTTACCTGGCTTGTTC
TTCTGCTTGATTTTCTTCATATTCTACAAAAGGGTCTTGTTATAAACTGGAATTGATCCTTAAAGGAAACCTACCAAAAAGGAAATTTTTTTGTTGTTAT
GAGATGTGGTTCCATCAGGTCATCTTGCAGCTTCAATCACTCAATAACCAACAGAGTAGTTTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase gma-MIR167c: 8.0E-14 PMRD gma-miR167c: 8.0E-14 microPC miR167: 8.0E-5 | UniProt no hits RFAM 1MIR167_1: 6.0E-15 | most similar mature miRNAs |
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