ABOUT THIS RECORDspecies: Sorghum bicolor
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTAAAAGATTCGTCTCGCAA miRNA* GCGAGACGATTTTTTAAATT mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTAGCTACTATAGTATTTTTGTTTTATTTAGTAATTAATATTCACTCGTAGATTAATTAAGTTTAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACAGACAAACTGTGT
AATTAGTTTTTTTGTCTAATATTTAATGTTCCGTGCACATGTCCAAAGATTTGATATGATGGATAAAAATATTTTGAGTGTGGAACTAACAAGGCATAAC
AATTACCAATGTGTCCATGATTGGAAAACTCACACAGTAGTACTTCGAGCCTGTTCGTTTTTCTTTTCGGCCGTACTTTTTCTGTTAGCTATGAGTGTTT
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TGGTTAAACACTAATTGATGTAATTACAAATCCTATAGTATGTATTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2124h: 0.00000003 PMRD osa-miR442: 0.0000005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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