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Species belonging to selected taxon:

Panicum virgatum, Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Cenchrus ciliaris, Zea mays, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008446
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIRf10
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TTTAAAAGATTCGTCTCGCAA

miRNA*
GCGAGACGATTTTTTAAATT

mismatches: 0
bulges: 1

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pre-miRNA
TTAGCTACTATAGTATTTTTGTTTTATTTAGTAATTAATATTCACTCGTAGATTAATTAAGTTTAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACAGACAAACTGTGT
AATTAGTTTTTTTGTCTAATATTTAATGTTCCGTGCACATGTCCAAAGATTTGATATGATGGATAAAAATATTTTGAGTGTGGAACTAACAAGGCATAAC
AATTACCAATGTGTCCATGATTGGAAAACTCACACAGTAGTACTTCGAGCCTGTTCGTTTTTCTTTTCGGCCGTACTTTTTCTGTTAGCTATGAGTGTTT
TTCTCTTACAATAAATTAGTCAATAGTAATTCAAACCAGCGAACAGTAAGTGTAGTGAACCTTAGTGCATCCTAAAACAGTGTGTACAAATCGATAATAT
TTGGATACATGTATAAAGTATTAAATGTACACTACTTACAAAACTAAAAACATAGATAGAGAATAATTTGCGAGACGATTTTTTAAATTTAATTAGTCTA
TGGTTAAACACTAATTGATGTAATTACAAATCCTATAGTATGTATTA


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124h: 0.00000003

PMRD osa-miR442: 0.0000005

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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