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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008496
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR1875
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ACAATGGAGTGAGGTGCAACG

miRNA*
 TTGCACCTTGCTCCATTGTGG

mismatches: 2
bulges: 0
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pre-miRNA
 GGCCTTGTTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGTCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACTGCGATGTTCATTTCCATTGCACCTTGCTCCATTG
TGGTATTGATGTTCTGCAGAAGCGAGTCCCTGTATCAAATAACTGTTGCAAGGTTGTTGGCATCGTCCATTGCCACACATGATACTATGCCACTAGCAGT
CGTCAGCTTCAACTGTGTGTTGTCGTATTGCATACACGGGTAGTAGGTGCATCAGCATTATAGCAGTTATTTGATACAGGAACTCTCCACTGTAGAAGTA
CAAACCCACAATGGAGTGAGGTGCAACGCAATGAACAATATGGTAGCAGAGTGAAAGTCTGTGGAATTGCCGGGGGCAAAGTGAAATTTATCCGACTATT
TATTTGT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR1875: 0.00000000002

PMRD osa-miR1875: 0.00000000002

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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