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Species belonging to selected taxon:

Agrostis stolonifera, Oryza sativa, Avena barbata, Avena sativa, Curcuma longa, Cynodon dactylon, Elaeis guineensis, Eragrostis curvula, Festuca arundinacea, Festuca pratensis, Hordeum vulgare, Hordeum vulgare subsp. spontaneum, Leymus cinereus x Leymus triticoides, Lolium perenne, Musa ABB Group, Panicum virgatum, Pseudoroegneria spicata, Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Triticum monococcum, Triticum turgidum subsp. durum, Zingiber officinale, Cenchrus ciliaris, Brachypodium distachyon, Zea mays, Triticum aestivum, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008496
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR1875
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ACAATGGAGTGAGGTGCAACG

miRNA*
TTGCACCTTGCTCCATTGTGG

mismatches: 2
bulges: 0

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pre-miRNA
GGCCTTGTTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGTCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACTGCGATGTTCATTTCCATTGCACCTTGCTCCATTG
TGG
TATTGATGTTCTGCAGAAGCGAGTCCCTGTATCAAATAACTGTTGCAAGGTTGTTGGCATCGTCCATTGCCACACATGATACTATGCCACTAGCAGT
CGTCAGCTTCAACTGTGTGTTGTCGTATTGCATACACGGGTAGTAGGTGCATCAGCATTATAGCAGTTATTTGATACAGGAACTCTCCACTGTAGAAGTA
CAAACCCACAATGGAGTGAGGTGCAACGCAATGAACAATATGGTAGCAGAGTGAAAGTCTGTGGAATTGCCGGGGGCAAAGTGAAATTTATCCGACTATT
TATTTGT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR1875: 0.00000000002

PMRD osa-miR1875: 0.00000000002

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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