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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008664
species: Brassica oleracea
miRNA family: MIR167
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Brassica oleracea Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTG

miRNA*
 GATCATCCTGCGGCTTCATT

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 TCTATGTTGGTTTTGAGAGGCTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGGCCGGCTGAGGCGCAGGTACAAGGGGGCGTGGACCCAGGGTCCAAATTTTTTTTTTC
ATAATTAGTGTTAAAATGGAGCTTGATTTTCAAAAAAAAAAATTTTAAAAGAGTCCAAAATTTTTAATTTATTTATAGAGTATATGTAAAACTTTTTTTT
TTGAAAAATTATTTTGTCCAAGGGCCTATAATTTACATGAGCTGGCCCTGGATGTATCTCTCAAATTAATATAATCTTAGTGTTAAAAATGTGTTTTCTC
CTCTTTTTCATGGATGCATGCATGTATGTGTGTGTATAAGTGTATAGATAGTGGTACCAGATCATCCTGCGGCTTCATTCACTCAAATCACCAACAA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase aly-MIR167d: 0.000000000001

PMRD ath-miR167d: 0.0000000004

microPC miR167: 0.0000000004		UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 0.00000003		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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