ABOUT THIS RECORDspecies: Crassostrea gigas
miRNA family: miR-1814a
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Crassostrea gigas Crassostrea Ostreidae Ostreoidea Ostreoida Pteriomorphia Bivalvia Mollusca Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGTTTTTTGGTTTTGTTTTG miRNA* GACGCGTTTGCCAGAAAACGAAT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
GGAAAGGTCTGGGGTTTTTTGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTAGGCTGCAGAATGTTAATACGACTCCGAAGGCTTTAATATTAAAATCT
AAAAAAATAAAGGATGAAGTCACCTCGGAATATCACCCTATTTACAGAATTGATAATTTTCAATACAGACGCGTTTGCCAGAAAACGAATTTGACTTC
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HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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