ABOUT THIS RECORDspecies: Medicago truncatula
miRNA family: MIR169
source: miRBase, original name: mtr-MIR169g (MI0005604)
Taxonomy by NCBI:
Medicago truncatula Medicago Trifolieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CAGCCAAGGATGACTTGCCGG miRNA* GGCAAGTCGTCTCTGGCTACG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGAGCCTCTTTCGATACTTTTATGACATAATTAATCATGTGGATAGCCAAGGTACTAAACTCACTTTGCACTAA
AACAAATATTTTTGCTTTAGTGCAAACTTAGTTTAGGCGCTTCGCAACGGCTAGTCAAATGTCCTAGTTCCAATGTGATTGGTTGTCCGGCAAGTCGTCT
CTGGCTACGTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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[1] Bonnet E, Unpublished (2007).,
ATATGCAGCCAAGGATGACTTGCCGGCGAGCCTCTTTCGATACTTTTATGACATAATTAATCATGTGGATAGCCAAGGTACTAAACTCACTTTGCACTAA
AACAAATATTTTTGCTTTAGTGCAAACTTAGTTTAGGCGCTTCGCAACGGCTAGTCAAATGTCCTAGTTCCAATGTGATTGGTTGTCCGGCAAGTCGTCT
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SIMILARITIES| miRBase gma-MIR169a: 0.0000002 PMRD gma-miR169a: 0.0000002 microPC miR169: 0.00001 | UniProt no hits RFAM MIR169_2: 1e-116 |
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[1] Bonnet E, Unpublished (2007).,
