ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum lycopersicum
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Solanum lycopersicum Lycopersicon Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTC miRNA* GCTCCTTGAAGTCCAACA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATA
GGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sly-MIR159: 4e-91 PMRD sly-miR159: 4e-91 microPC miR319: 7e-96 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-87 |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST046340) |
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