ABOUT THIS RECORDspecies: Avena sativa
source: PMRD, original name: asa-miR1122
Taxonomy by NCBI:
Avena sativa Avena Aveninae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TACTCCCTCCGTCACAAAAAGGAT miRNA* CCTTTTCGGGACGGAGGGAGTACA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AATGCTAGTACGAAATTTTGAACTACTCCCTCCGTCACAAAAAGGATGTCTCAAGTTTGTTTGAATTTGGACGAATCTATATATTAAATAGTGTCTAGAT
ACATCCAAGTTTAGACAAATTTGATACATCCTTTTCGGGACGGAGGGAGTACATGTTTGGACAGGTTGTGGTGAAACCG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1862a: 0.0006 PMRD bsy-miR1122: 0.000000000002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 6e-72 |
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